U cilju efikasnijeg i racionalnijeg obavljanja delatnosti i kontrole stručnog rada u Domu zdravlja se funkcionalnom principu, a u skladu sa Pravilnikom o uslovima i načinu unutrašnje organizacije zdravstvenih ustanova (Sl. Glasnik RS br. 43/2006) i Statuta Doma zdravlja obrazuju sledeće organizacione jedinice:
Služba za zdravstvenu zaštitu dece i žena sa polivalentnom patronažom
Odeljenje za zdravstvenu zaštitu dece
Odeljenje za zdravstvenu zaštitu žena
Odeljenje za polivalentnu patronažu
Služba opšte medicine, sa hitnom medicinskom pomoći i kućnim lečenjem
Odeljenje opšte medicine sa kućnim lečenjem
Odeljenje hitne medicinske pomoći
Služba stomatološke zdravstvene zaštite
Dve Ambulante opšte stomatologije u Beočinu
Zubna tehnika u Beočinu
Ambulanta dečije stomatologije u Osnovnoj školi „Jovan Grčić – Milenko“ Beočin
Ambulante Stomatološke zaštite Čerević i Susek
Služba za laboratorijsku dijagnostiku
Služba laboratorijske dijagnostike svoju delatnost obavlja u sedištu Doma zdravlja u Beočinu.
Služba za fizikalnu medicinu i rehabilitaciju i specijalističko konsultativnu delatnost
Odeljenje fizikalne medicine i rehabilitacije
Odeljenje radiološke dijagnostike
Odeljenje pnuemoftiziološke zaštite
Odeljenje interne medicine
Služba za pravne, ekonomske, finansijske, tehničke i druge poslove
Odeljenje za pravne i ekonomsko finansijske poslove
Odeljenje za poslove transporta, tehničkog održavanja i održavanja higijene